Mathematical topics in phylogenetics
Visualitza/Obre
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/103899
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2017-03
Condicions d'accésAccés obert
Llevat que s'hi indiqui el contrari, els
continguts d'aquesta obra estan subjectes a la llicència de Creative Commons
:
Reconeixement-NoComercial-SenseObraDerivada 3.0 Espanya
Abstract
An evolutionary process is frequently modeled as a sequence of the four bases A,C,G,T, each of them changing independently following a Markov process. The main goal of this project are two: first of all, we wanted to understand and explain, from a mathematically rigorous point of view, the modeling of an evolutionary process as a continuous Markov process, and why Lie Markov models are an adequate option for this task. Secondly, we explain how we tried to improve a previous implementation of Lie Markov models in IQ-TREE, an algorithm for inferring phylogenies.
TitulacióMÀSTER UNIVERSITARI EN MATEMÀTICA AVANÇADA I ENGINYERIA MATEMÀTICA (Pla 2010)
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
memoria.pdf | 639,0Kb | Visualitza/Obre |