A new gene-based association test for genome-wide association studies
Visualitza/Obre
Cita com:
hdl:2117/9715
Tipus de documentArticle
Data publicació2009-12-15
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
Genome-wide association studies are widely used today to discover genetic factors that modify the risk of complex diseases. Usually, these methods work in a SNP-by-SNP fashion. We present a gene-based test that can be applied in the context of genome-wide association studies. We compare both strategies, SNP-based and gene-based, in a sample of cases and controls for rheumatoid arthritis. We obtained different results using each strategy. The SNP-based test found the PTPN22 gene while the gene-based test found the PHF19-TRAF1-C5 region. That suggests that no single strategy performs better than another in all cases and that a certain underlying genetic architecture can be delineated more easily with one strategy rather than with another.
CitacióBuil, A. [et al.]. A new gene-based association test for genome-wide association studies. "BMC proceedings (Online)", 15 Desembre 2009, vol. 15, núm. 3, p. 1-5.
ISSN1753-6561
Versió de l'editorhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2795904/?tool=pubmed
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
1753-6561-3-S7-S130.pdf | 187,9Kb | Visualitza/Obre |