Applications of the Sinkhorn-Knopp algorithm for phylogenetic inference

Abstract

En aquest treball s'estudia l'algorisme de Sinkhorn-Knopp i les seves aplicacions pel disseny de mètodes de reconstrucció filogenètica. Es dissenyen tres mètodes filogenètics ("Crossing", "$\delta$-crossing$ i Dist-crossing) i es testen en el treespace de Huelsenbeck i en quartets amb arestes de longitud arbitrària. Aquests resultats es comparen amb mètodes de reconstrucció genètica clàssics (NJ, ML, ErikSVD i Erik+2).