Mostra el registre d'ítem simple

dc.contributorGinovart Gisbert, Marta
dc.contributorBlanco Abellán, Mónica
dc.contributor.authorViteri León, Ángel
dc.date.accessioned2016-01-28T10:45:30Z
dc.date.issued2016-01-27
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2117/82211
dc.description.abstractNowadays there are multiple resources that exist in the field of digital imaging to study biological systems. Processing techniques and digital image analysis are being placed in scientific activity in all fields of biology, especially in microbiology. The morphometry of the yeast, microorganisms that can reproduce by budding under certain conditions, has been investigated in recent years as it reports on the status of populations and their productive capacity. In a previous experimental project, a set of digital images were taken from Saccharomyces (cerevisiae) bayanus DV10 growing in two different mediums, aerobic and microaerophilic, and in different time points of the phases of population growth. These images need to be processed and analyzed in depth to get the information they contain. This project was carried out the treatment of these digital images with the free program (Fiji) ImageJ and a protocol analysis has been established, processing 7694 cells under aerobic growth and 2371 cells under microaerophilic growth. To determine the kinetic parameters and the time between changes of phase (lag to exponential, and exponential to stationary) the piecewise linear model of Buchanan for microbial growth has been adjusted to the different temporal evolution of the number of cells of the populations of different experiments. For all yeast cells analyzed were obtained values of different selected morphological parameters: area, perimeter, major diameter, minor diameter, circularity and elongation, and the results have statistically analyzed by growth phases and according to budding state. Numerical and graphical descriptions have done in order to characterize the different stages of growth and budding state in the different experimental conditions. Parameters or parameter combinations have established to know which are most useful for discrimination by state according to budding and growth phase, in both growth conditions.
dc.description.abstractActualment són múltiples els recursos que hi ha en l'àmbit de la imatge digital per a investigar sistemes biològics. Les tècniques de processament i anàlisi de la imatge digital s'estan instaurant en l'activitat científica, en tots els camps de la biologia, i en particular en la microbiologia. La morfometria dels llevats, microorganismes que poden reproduir-se per gemmació sota certes condicions, ha estat objecte d'investigació en els últims anys ja que informa sobre l'estat de les poblacions i la seva capacitat productiva. En un treball experimental previ es va obtenir un conjunt d'imatges digitals preses de Saccharomyces (cerevisiae) bayanus DV10 creixent en dos condicions diferents, condicions aeròbies i condicions microaeròfiles, i en diferent moments temporals de les fases de creixement de la població. Aquestes imatges requerien ser processades i analitzades en profunditat per obtenir la informació que contenen. En aquest treball s'ha realitzat el tractament d'aquestes imatges digitals amb el programa lliure (Fiji) ImageJ i s'ha establert el protocol d'anàlisi, processant 7694 cèl·lules en condicions de creixement aerobi i 2371 cèl·lules en condicions de creixement microaeròfil. Per poder determinar els paràmetres cinètics i els temps entre canvis de fase (de adaptación a exponencial, i de exponencial a estacionària) s'ha ajustat el model lineal a trossos de Buchanan per al creixement microbià a les diferents evolucions temporals del nombre de cèl·lules de les poblacions dels diferents experiments. S'han obtingut per a totes aquestes cèl·lules de llevats analitzades els valors dels diferents paràmetres morfològics escollits: àrea, perímetre, diàmetre major, diàmetre menor, circularitat i elongació, i s'han analitzat estadísticament els resultats segons fases de creixement i segons estat de gemmació. S'han realitzat descripcions numèriques i gràfiques que permeten caracteritzar les diferents fases del creixement i l'estat de gemmació en les diferents condicions experimentals. S'ha establert quins paràmetres, o combinacions de paràmetres, són més útils per a realitzar una discriminació segons l'estat de gemmació i segons la fase de creixement, en les dues condicions de creixement.
dc.description.abstractActualmente son múltiples los recursos que existen en el ámbito de la imagen digital para investigar sistemas biológicos. Las técnicas de procesado y análisis de la imagen digital se están instaurando en la actividad científica, en todos los campos de la biología, y en particular en la microbiología. La morfometría de las levaduras, microorganismos que pueden reproducirse por gemación bajo ciertas condiciones, ha sido objeto de investigación en los últimos años ya que informa sobre el estado de las poblaciones y su capacidad productiva. En un trabajo experimental previo se obtuvo un conjunto de imágenes digitales tomadas de Saccharomyces (cerevisiae) bayanus DV10 creciendo en dos condiciones diferentes, condiciones aerobias y condiciones microaerófilas, y en distintos momentos temporales de las fases de crecimiento de la población. Dichas imágenes requerían ser procesadas y analizadas en profundidad para obtener la información que contienen. En este trabajo se ha realizado el tratamiento de estas imágenes digitales con el programa libre (Fiji) ImageJ y se ha establecido el protocolo de análisis, procesando 7694 células en condiciones de crecimiento aerobio y 2371 células en condiciones de crecimiento microaerófilo. Para poder determinar los parámetros cinéticos y los tiempos entre cambios de fase (de adaptación a exponencial, y de exponencial a estacionaria) se ha ajustado el modelo lineal a trozos de Buchanan para el crecimiento microbiano a las distintas evoluciones temporales del número de células de las poblaciones de los distintos experimentos. Se han obtenido para todas estas células de levaduras analizadas los valores de los distintos parámetros morfológicos escogidos: área, perímetro, diámetro mayor, diámetro menor, circularidad y elongación, y se han analizado estadísticamente los resultados según fases de crecimiento y según estado de gemación. Se han realizado descripciones numéricas y gráficas que permiten caracterizar las distintas fases del crecimiento y el estado de gemación en las distintas condiciones experimentales. Se ha establecido qué parámetros, o combinaciones de parámetros, son más útiles para realizar una discriminación según el estado de gemación y según la fase de crecimiento, en las dos condiciones de crecimiento.
dc.language.isospa
dc.publisherUniversitat Politècnica de Catalunya
dc.subjectÀrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària
dc.subjectÀrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia
dc.subject.lcshSaccharomyces cerevisiae
dc.subject.otherSaccharomyces cerevisiae
dc.subject.otherMorfometría
dc.subject.otherAerobio
dc.subject.otherMicroaerófilo
dc.subject.otherAnálisis de imágenes
dc.subject.otherAnálisis discriminante.
dc.titleTratamiento y análisis de imágenes digitales de células de Saccharomyces (cerevisiae) bayanus creciendo en dos concentraciones de oxígeno distintas
dc.typeBachelor thesis
dc.subject.lemacAnàlisi discriminant
dc.rights.accessRestricted access - author's decision
dc.date.lift10000-01-01
dc.date.updated2016-01-28T06:42:12Z
dc.audience.educationlevelEstudis de primer/segon cicle
dc.audience.mediatorEscola Superior d'Agricultura de Barcelona
dc.audience.degreeGRAU EN ENGINYERIA DE SISTEMES BIOLÒGICS (Pla 2009)


Fitxers d'aquest items

Imatge en miniatura

Aquest ítem apareix a les col·leccions següents

Mostra el registre d'ítem simple