Quan hi ha canvis ambientals, aquests són percebuts per les plantes, les quals poden respondre modificant el seu desenvolupament per adaptar-se a la nova situació. Les senyals ambientals són captades per receptors, que activen una cascada de senyalització que acaba al nucli, on es regula l'activitat de determinats factors de transcripció, que són els encarregats directes de controlar l'expressió dels gens de resposta a l'ambient. Els factors de transcripció són claus per a determinar l'activitat transcripcional. Al ser proteïnes d'unió al DNA, l'estat de la cromatina serà un factor determinant en el control de la seva activitat. Aquest treball relacionarà l'activitat dels factors de transcripció anomenats PHYTOCHROME INTERACTING FACTORS (FACTORS D'INTERACCIÓ AMB FITOCROMS, PIFs) amb canvis en la estructura de la cromatina, concretament amb la trimetilació de la lisina 27 de la histona H3 (H3K27me3). Els PIFs participen en la regulació de les respostes a llum. Aquest treball s'ha centrat en l'activitat dels PIF4, PIF5 i PIF7 en resposta a proximitat vegetal, també anomenada ombra. Dades preliminars del laboratori indiquen que la marca epigenètica H3K27me3 es eliminada en alguns gens de resposta a proximitat vegetal. A partir d'aquestes dades, hem analitzat l'impacte que pot tenir l'activitat dels PIFs en els nivells d'H3K27me3. Utilitzant línies mutants i transgèniques de la planta model Arabidopsis thaliana hem pogut correlacionar l'expressió de gens en resposta a ombra i correlacionar-los amb els nivells d'H3K27me3 analitzats per immunoprecipitació de cromatina (ChIP).
Cuando hay cambios ambientales, éstos son percibidos por las plantas, las cuales pueden responder modificando su desarrollo para adaptarse a la nueva situación. Las señales ambientales son captadas por receptores, que activan una cascada de señalización que termina en el núcleo, donde se regula la actividad de determinados factores de transcripción, que son los encargados directos de controlar la expresión de los genes de respuesta en el ambiente. Los factores de transcripción son claves para determinar la actividad transcripcional. Al ser proteínas de unión al ADN, el estado de la cromatina será un factor determinante en el control de su actividad. Este trabajo relacionará la actividad de los factores de transcripción llamados PHYTOCHROME INTERACTING FACTORS (FACTORES DE INTERACCIÓN CON FITOCROMOS, PIFs) con cambios en la estructura de la cromatina, concretamente con la trimetilación de la lisina 27 de la histona H3 (H3K27me3). Los PIFs participan en la regulación de las respuestas a luz. Este trabajo se ha centrado en la actividad de los PIF4, PIF5 y PIF7 en respuesta a proximidad vegetal, también llamada sombra. Datos preliminares del laboratorio indican que la marca epigenética H3K27me3 se elimina en algunos genes de respuesta a proximidad vegetal. A partir de estos datos, hemos analizado el impacto que puede tener la actividad de los PIFs en los niveles de H3K27me3. Utilizando líneas mutantes y transgénicas de la planta modelo Arabidopsis thaliana hemos podido correlacionar la expresión de genes en respuesta a sombra y correlacionarlos con los niveles de H3K27me3 analizados por inmunoprecipitación de cromatina (ChIP).
When there are environmental changes, these are perceived by the plants, which can respond by modifying their development to adapt to the new situation. Environmental signals are captured by receptors, which activate a signaling cascade that ends in the nucleus, where the activity of certain transcription factors is regulated, which are directly responsible for controlling the expression of environmental response genes. Transcription factors are key to determining transcriptional activity. As they are DNA-binding proteins, the state of the chromatin will be a determining factor in the control of their activity. This work will relate the activity of the transcription factors called PHYTOCHROME INTERACTING FACTORS (PHYTOCHROME INTERACTING FACTORS, PIFs) with changes in the chromatin structure, specifically with the trimethylation of lysine 27 of histone H3 (H3K27me3). PIFs participate in the regulation of responses to light. This work has focused on the activity of PIF4, PIF5 and PIF7 in response to plant proximity, also called shade. Preliminary data from the laboratory indicate that the H3K27me3 epigenetic mark is removed in some plant proximity response genes. Based on these data, we analyzed the impact that the activity of PIFs can have on the levels of H3K27me3. Using mutant and transgenic lines of the model plant Arabidopsis thaliana we were able to correlate the expression of genes in response to shade and correlate them with the levels of H3K27me3 analyzed by chromatin immunoprecipitation (ChIP).
gmail.com
