Implementation of a test for branch saturation in a phylogenetic tree
Visualitza/Obre
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/375072
Realitzat a/ambCenter for Integrative Bioinformatics Vienna
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2022-10
Condicions d'accésAccés obert
Llevat que s'hi indiqui el contrari, els
continguts d'aquesta obra estan subjectes a la llicència de Creative Commons
:
Reconeixement-NoComercial-CompartirIgual 3.0 Espanya
Abstract
In a phylogenetic tree, branch saturation is the occurrence of too many mutations along a branch as to provide information about the branch location and length. Since branch saturation leads to unreliable reconstructed trees, testing all branches for saturation is a necessary step in any accurate reconstruction protocol. The core of this work is the software implementation of the asymptotic test for branch saturation. After presenting three examples using different trees, the concept of saturation and its causes are analysed.
TitulacióMÀSTER UNIVERSITARI EN MATEMÀTICA AVANÇADA I ENGINYERIA MATEMÀTICA (Pla 2010)
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
memoria.pdf | 3,499Mb | Visualitza/Obre |