El treball de fi de grau té com a principal objectiu el genotipat de diferents mostres de gerds i maduixes per a diferents estudis genètics, mitjançant biotecnologies com els marcadors moleculars, que són seqüències d'ADN (àcid desoxiribonucleic) identificables que es troben repartides en tot el genoma i que poden estar relacionades amb l'herència d'un gen o una característica d’interès. Per a dur a terme els diferents estudis genètics en diferents tipus de baies, com són el gerd (espècie diploide) i la maduixa conreada (espècie octoploide) s'han utilitzat dos tipus de marcadors moleculars, d'herència codominant i millor repartits en tot el genoma, que són els polimorfismes de nucleòtids simples (SNPs, de l’anglès Single Nucleotide Polymorfisms) i els microsatèl·lits o SSRs (de l’anglès Simple Sequence Repeats). El genotipat amb SNPs fent ús de diferents xips tipus `OpenArray’ ens ha servit per estudiar la variabilitat de dues col·leccions de varietats de maduixa i gerd i per construir, finalment, dendrogrames per visualitzar les distàncies genètiques entre les diferents línies. També hem realitzat exitosament un estudi d'identificació varietal de mostres de gerd utilitzant marcadors tipus microsatèl·lit.
The main objective of my Bachelor's thesis is the genotyping of different samples of berries for different genetic studies, using biotechnologies such as molecular markers, which are identifiable DNA (deoxyribonucleic acid) sequences that are distributed throughout the genome and may be related to the inheritance of a gene or a trait of interest. To carry out the different genetic studies in different berries, such as raspberry (diploid species) and cultivated strawberry (octoploid species), two types of molecular markers of codominant inheritance and better distributed across the genome were used, that are SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) and microsatellites, also called SSRs (Simple Sequence Repeats). With the SNP genotyping using different 'OpenArray' chips we have studied the variability of two collections of strawberry and raspberry varieties and we have constructed dendrograms to display genetic distances between the different lines. A varietal identification study of raspberry samples was also successfully performed using microsatellite markers.
El trabajo de fin de grado tiene como principal objetivo el genotipado de diferentes muestras de frambuesas y fresas para diferentes estudios genéticos, mediante biotecnologías como los marcadores moleculares, que son secuencias de ADN (ácido desoxirribonucleico) identificables que se encuentran repartidas en todo el genoma y que pueden estar relacionadas con la herencia de un gen o una característica de interés. Para llevar a cabo los diferentes estudios genéticos en diferentes tipos de bayas, como son la frambuesa (especie diploide) y la fresa cultivada (especie octoploide) se han utilizado dos tipos de marcadores moleculares, de herencia codominante y mejor repartidos en todo el genoma, que son los polimorfismos de nucleótidos simples (SNPs, del inglés Single Nucleotide Polymorfisms) y los microsatélites o SSRs (del inglés Simple Sequence Repeats). El genotipado con SNPs en uso de diferentes chips tipos `OpenArray¿ nos ha servido para estudiar la variabilidad de dos colecciones de variedades de fresa y frambuesa y para construir, finalmente, dendrogramas para visualizar las distancias genéticas entre las diferentes líneas. También hemos realizado exitosamente un estudio de identificación varietal de muestras de frambuesa utilizando marcadores tipos microsatélite
