The statistical challenges of microbiome analysis in relation with colorectal cancer
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Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
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hdl:2117/347921
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2021-06
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Abstract
En los últimos tiempos el cáncer ha sido el mayor problema socio-sanitario en todo el mundo, siendo la segunda causa principal de muerte. Además, el microbioma humano, fundamentalmente compuesto por bacterias, ha cobrado fuerte interés en los últimos años debido a resultados de estudios que sustentan que la microbiota puede afectar al riesgo de desarollar cáncer, así como muchas otras enfermedades. El uso potencial del microbioma del intestino, el más numeroso y diverso del cuerpo humano, como herramienta para diagnosticar el cáncer de colon ha ya sido propuesta, pero sin embargo aún no validada. Este proyecto, en el marco del Programa Analítico de Datos Oncológicos del Institut Català d'Oncologia, investiga la posible asociación entre 641 bacterias del microbioma con la ocurrencia de cáncer colorectal de 156 individuos, pero centrándose en los retos estadísticos que tiene este objetivo cuando se abordan datos de microbioma. Además, los datos precisaban ser transformados para eliminar el efecto de las variables sociodemográficas así como los contajes cero. Distintas metodologías han sido empleadas, mayoritariamente mediante un enfoque composicional, tales como el Análisis de Componentes Principales, el Análisis Discriminante y la Regresión Logística Multinomial, así como una propuesta de método propio, siendo capaces de detectar algunas bacterias y grupos de ellas asociadas con el estado de cáncer.
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
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