Random forest as a tumour genetic marker extractor
Visualitza/Obre
Cita com:
hdl:2117/186309
Tipus de documentText en actes de congrés
Data publicació2019
EditorIOS Press
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
ProjecteCOMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES VII (MINECO-TIN2015-65316-P)
BARCELONA SUPERCOMPUTING CENTER - CENTRO. NACIONAL DE SUPERCOMPUTACION (MINECO-SEV-2015-0493)
BARCELONA SUPERCOMPUTING CENTER - CENTRO. NACIONAL DE SUPERCOMPUTACION (MINECO-SEV-2015-0493)
Abstract
Finding tumour genetic markers is essential to biomedicine due to their relevance for cancer detection and therapy development. In this paper, we explore a recently released dataset of chromosome rearrangements in 2,586 cancer patients, where different sorts of alterations have been detected. Using a Random Forest classifier, we evaluate the relevance of several features (some directly available in the original data, some engineered by us) related to chromosome rearrangements. This evaluation results in a set of potential tumour genetic markers, some of which are validated in the bibliography, while others are potentially novel.
CitacióPérez, R. [et al.]. Random forest as a tumour genetic marker extractor. A: International Conference of the Catalan Association for Artificial Intelligence. "Proceedings of the 22nd International Conference of the Catalan Association for Artificial Intelligence". IOS Press, 2019, p. 35-44.
ISBN978-1-64368-015-6
Versió de l'editorhttp://ebooks.iospress.nl/volumearticle/52819
Col·leccions
- Departament de Ciències de la Computació - Ponències/Comunicacions de congressos [1.274]
- Computer Sciences - Ponències/Comunicacions de congressos [574]
- KEMLG - Grup d'Enginyeria del Coneixement i Aprenentatge Automàtic - Ponències/Comunicacions de congressos [110]
- CAP - Grup de Computació d'Altes Prestacions - Ponències/Comunicacions de congressos [784]
- Departament d'Arquitectura de Computadors - Ponències/Comunicacions de congressos [1.954]
- Life Sciences - Ponències/Comunicacions de congressos [18]
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
Random forest.pdf | 207,2Kb | Visualitza/Obre |