Visualization of sequence and structural features of genomes and chromosome fragments. Application to CpG islands, Alu sequences and whole genomes
Visualitza/Obre
"Review" (1,994Mb) (Accés restringit)
Sol·licita una còpia a l'autor
Què és aquest botó?
Aquest botó permet demanar una còpia d'un document restringit a l'autor. Es mostra quan:
- Disposem del correu electrònic de l'autor
- El document té una mida inferior a 20 Mb
- Es tracta d'un document d'accés restringit per decisió de l'autor o d'un document d'accés restringit per política de l'editorial
Cita com:
hdl:2117/13244
Tipus de documentArticle
Data publicació2011-03-01
Condicions d'accésAccés restringit per política de l'editorial
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
A very simple new program is presented (G-SQUARES). It is useful in order to visualize the composition and basic structural features of whole genomes and selected chromosome regions. The frequency of all dimer and tetramer sequences is reported. Overall structural features are calculated, such as the tendency for alternation. A direct visual comparison among different sequences is easily available. Furthermore, the features which are visualized indicate further studies which should be carried out. Examples are presented on Alu sequences, CpG islands, whole eukaryotic and bacterial genomes.
CitacióSubirana, J.; Anokian, E. Visualization of sequence and structural features of genomes and chromosome fragments. Application to CpG islands, Alu sequences and whole genomes. "Gene", 01 Març 2011, vol. 473, núm. 2, p. 76-81.
ISSN0378-1119
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
Visualization o ... hromosome fragments....pdf | "Review" | 1,994Mb | Accés restringit |