Visual analysis of protein-ligand interactions
Visualitza/Obre
Cita com:
hdl:2117/121534
Tipus de documentArticle
Data publicació2018-06
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
ProjecteGENERACION, SIMULACION Y VISUALIZACION DE MODELOS 3D A PARTIR DE GRANDES CONJUNTOS DE DATOS. APLICACIONES EN LA MEJORA DE LA CALIDAD DE VIDA DE LAS PERSONAS Y SU ENTORNO (MINECO-TIN2014-52211-C2-1-R)
VISUALIZACION, MODELADO, SIMULACION E INTERACCION CON MODELOS 3D. APLICACIONES EN CIENCIAS DE LA VIDA Y ENTORNOS RURALES Y URBANOS (AEI-TIN2017-88515-C2-1-R)
VISUALIZACION, MODELADO, SIMULACION E INTERACCION CON MODELOS 3D. APLICACIONES EN CIENCIAS DE LA VIDA Y ENTORNOS RURALES Y URBANOS (AEI-TIN2017-88515-C2-1-R)
Abstract
The analysis of protein-ligand interactions is complex because of the many factors at play. Most current methods for visual analysis provide this information in the form of simple 2D plots, which, besides being quite space hungry, often encode a low number of different properties. In this paper we present a system for compact 2D visualization of molecular simulations. It purposely omits most spatial information and presents physical information associated to single molecular components and their pairwise interactions through a set of 2D InfoVis tools with coordinated views, suitable interaction, and focus+context techniques to analyze large amounts of data. The system provides a wide range of motifs for elements such as protein secondary structures or hydrogen bond networks, and a set of tools for their interactive inspection, both for a single simulation and for comparing two different simulations. As a result, the analysis of protein-ligand interactions of Molecular Simulation trajectories is greatly facilitated.
CitacióVázquez, P., Hermosilla, P., Guallar, V., Estrada, J., Vinacua, A. Visual analysis of protein-ligand interactions. "Computer graphics forum", Juny 2018, vol. 37, núm. 3, p. 391-402.
ISSN0167-7055
Versió de l'editorhttps://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/cgf.13428
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
BondsVisEuroVis2018FinalNoLogos.pdf | 3,237Mb | Visualitza/Obre |