Mostra el registre d'ítem simple
Hybrid cell-centred/vertex model for multicellular systems
dc.contributor | Muñoz Romero, José |
dc.contributor.author | Mosaffa, Payman |
dc.contributor.other | Universitat Politècnica de Catalunya. Facultat de Matemàtiques i Estadística |
dc.date.accessioned | 2018-02-28T12:37:16Z |
dc.date.available | 2018-02-28T12:37:16Z |
dc.date.issued | 2017-11-11 |
dc.identifier.citation | Mosaffa, P. Hybrid cell-centred/vertex model for multicellular systems. Tesi doctoral, UPC, Facultat de Matemàtiques i Estadística, 2017. DOI 10.5821/dissertation-2117-114623. |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/2117/114623 |
dc.description.abstract | This thesis presents a hybrid vertex/cell-centred approach to mechanically simulate planar cellular monolayers undergoing cell reorganisation. Cell centres are represented by a triangular nodal network, while the cell boundaries are formed by an associated vertex network. The two networks are coupled through a kinematic constraint which we allow to relax progressively. Cell-cell connectivity changes due to cell reorganisation or remodelling events, are accentuated. These situations are handled by using a variable resting length and applying an Equilibrium-Preserving Mapping (EPM) on the new connectivity, which computes a new set of resting lengths that preserve nodal and vertex equilibrium. As a by-product, the proposed technique enables to recover fully vertex or fully cell-centred models in a seamless manner by modifying a numerical parameter of the model. The properties of the model are illustrated by simulating monolayers subjected to imposed extension and during a wound healing process. The evolution of forces and the EPM are analysed during the remodelling events. |
dc.description.abstract | Esta tesis presenta un modelo híbrido para la simulación mecánica de monocapas celulares. Este modelo combina métodos de vértices y centrados en la célula, y está orientado al análisis de deformaciones con reorganización celular. Los núcleos vienen representados por nodos que forman una malla triangular, mientras que las contornos (membranas y córtex) forman una malla poligonal de vértices. Las dos mallas se acoplan a través de una restricción cinemática que puede ser relajada de forma controlada. El estudio hace especial hincapié en los cambios de conectividad, tanto debidos a la reorganización celular como el remodelado del citoesqueleto. Estas situaciones se abordan a través de una longitud de referencia variable y aplicando un Mapeo con Conservación de Equilibrio (EPM) que minimiza el error en el equilibrio nodal y en los vértices. La técnica resultante puede ser adaptada progresivamente a través de un parámetro, dando lugar a un modelo exclusivamente de vértices o a uno de centros. Sus propiedades se ilustran en simulaciones de monocapas sujetas a una extensión impuesta y durante el proceso de cicatrizado de heridas. La evolución de las fuerzas y los efectos del EPM durante el remodelado se analizan en estos ejemplos. |
dc.format.extent | 126 p. |
dc.language.iso | eng |
dc.publisher | Universitat Politècnica de Catalunya |
dc.rights | ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. |
dc.source | TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) |
dc.subject | Àrees temàtiques de la UPC::Matemàtiques i estadística |
dc.title | Hybrid cell-centred/vertex model for multicellular systems |
dc.type | Doctoral thesis |
dc.identifier.doi | 10.5821/dissertation-2117-114623 |
dc.rights.access | Open Access |
dc.description.version | Postprint (published version) |
dc.identifier.tdx | http://hdl.handle.net/10803/461678 |
Fitxers d'aquest items
Aquest ítem apareix a les col·leccions següents
-
Facultat de Matemàtiques i Estadística [118]
-
Totes les tesis [5.461]