Cerca de patrons per l'anàlisi de la significació biològica en experiments d'estrès tèrmic

Abstract

L'objectiu principal del projecte és, a partir de les dades d'expressió gènica obtingudes de l'organisme del llevat mitjançant la tècnica dels macroarrays, trobar grups de gens que es comporten de manera similar. Per fer això, un cop netejades les dades, s'ha implementat l'algorisme DIB-C basat en les primeres i segones diferències entre un instant de temps i el següent. Categoritzant aquestes diferències s'obté un patró per a cada gen que ens permet crear els clusters. Un cop obtinguts els grups de gens i per ajudar a l'investigador a interpretar els resultats, s'aplicarà un anàlisi d'enriquiment. Aquest anàlisi servirà per de nir quines funcions tenen els gens dels clusters en els processos moleculars que es donen dins la cèl·lula, atès que se suposa que els gens d'un mateix cluster tindran un paper semblant.. Trobar la metodologia adient per a determinar els patrons de comportament dels gens del llevat de cervesa en un experiments d'estrès tèrmic (heat shock) en el quals s'han realitzat mesures al llarg de 12 instants de temps posteriorment a l'efecte tèrmic. La cerca d'aquests patrons ha de permetre agrupar els gens en grups homogenis en quant al comportament al llarg del temps, de cara a en un futur poder determinar funcions que s'adaptin a aquests patrons.