Mostra el registre d'ítem simple
Reconstruction of phylogenetic trees using quartet methods
dc.contributor | Casanellas Rius, Marta |
dc.contributor | Fernández, Jesús |
dc.contributor.author | Sabaté Vidales, Marc |
dc.contributor.other | Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Matemàtica Aplicada I |
dc.date.accessioned | 2014-03-03T11:12:01Z |
dc.date.issued | 2014-01 |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/2099.1/20844 |
dc.description.abstract | Els arbres filogenètics ajuden a modelitzar l'evolució de les espècies. En aquests arbres, les fulles representen les espècies actuals, l'arrel representa l'ancestre comú a totes aquestes espècies i cada branca un procés d'especiació. Per a poder inferir les relacions filogenètiques d'un conjunt d'espècies actuals, podem aspirar a conèixer el genoma d'aquestes espècies, tot i que no disposem d'informació del genoma dels ancestres d'aquestes espècies. Existeix un bon nombre de mètodes de reconstrucció filogenètica. En aquest treball, hem implementat i hem analitzat els resultats de 12 mètodes de reconstrucció per quartets. En aquests mètodes, donat un conjunt d'espècies actuals, s'infereixen les relacions filogenètiqes entre tots els subconjunts de 4 espècies dins del conjunt original, i a continuació es combina tota aquesta informació per a construir l'arbre filogenètic resultant. . Tècniques algebraiques desenvolupades recentment permeten usar el rang de certes matrius per a reconstruir l'arbre filogenètic d'un conjunt d'espècies. En aquest projecte s'usaran aquestes tècniques dins de mètodes de reconstrucció filogenètica basats en quartets. S'implementaran diferents mètodes de quartets i es faran tests per avaluar l'eficàcia dels mètodes |
dc.language.iso | eng |
dc.publisher | Universitat Politècnica de Catalunya |
dc.subject | Àrees temàtiques de la UPC::Matemàtiques i estadística |
dc.subject.lcsh | Biomathematics |
dc.subject.other | Phylogenetic trees |
dc.subject.other | Svd |
dc.subject.other | Neighbor-Joining |
dc.subject.other | Quartet Puzzling |
dc.subject.other | Weight Optimization |
dc.subject.other | Willson |
dc.subject.other | Cofrobtail |
dc.title | Reconstruction of phylogenetic trees using quartet methods |
dc.title.alternative | Reconstrucció filogenètica basada en quarterts |
dc.type | Master thesis |
dc.subject.lemac | Biomatemàtica |
dc.subject.ams | Classificació AMS::92 Biology and other natural sciences::92B Mathematical biology in general |
dc.rights.access | Restricted access - author's decision |
dc.date.lift | 10000-01-01 |
dc.audience.educationlevel | Màster |
dc.audience.mediator | Universitat Politècnica de Catalunya. Facultat de Matemàtiques i Estadística |
dc.audience.degree | MÀSTER UNIVERSITARI EN MATEMÀTICA AVANÇADA I ENGINYERIA MATEMÀTICA (Pla 2010) |