Design of RNA-sequencing alternative splicing experiments
Visualitza/Obre
memoria.pdf (1,099Mb) (Accés restringit)
Sol·licita una còpia a l'autor
Què és aquest botó?
Aquest botó permet demanar una còpia d'un document restringit a l'autor. Es mostra quan:
- Disposem del correu electrònic de l'autor
- El document té una mida inferior a 20 Mb
- Es tracta d'un document d'accés restringit per decisió de l'autor o d'un document d'accés restringit per política de l'editorial
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2099.1/19442
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2013-07
Condicions d'accésAccés restringit per decisió de l'autor
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
Alternative Splicing (AS) is a biological process that allows a single gene to code for different proteins. The aim of this thesis is to design RNA-sequencing AS experiments. Traditional experiment design approaches require a prior guess regarding the future observed data, which is unfeasible in a high-dimensional setup like ours. To address this issue, our approach uses posterior predictive simulations (based on pilot data) to evaluate the expected utility of multiple experimental settings. This methodology is applied to one sample and multiple sample problems, and case-studies with real data are discussed. An implementation has been coded for the Bioconductor library casper.. Alternative Splicing (AS) is a biological process that allows a single gene to code for different proteins. The aim is to design RNA-sequencing AS experiments. Traditional approaches require a prior guess regarding the future observed data, which is unfeasible in a high-dimensional setup like ours. Our approach uses posterior predictive simulations (based on pilot data) to evaluate the expected utility of multiple experimental settings. This methodology is applied to one sample and multiple sample problems, and case-studies with real data are discussed.
Descripció
Institut de Recerca Biomèdica (IRB)/ Institute for Reserarch in Biomedicine (IRB)
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
memoria.pdf | 1,099Mb | Accés restringit |