Generating Lie Markov models with prescribed symmetry
Visualitza/Obre
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2099.1/17481
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2012-11
Condicions d'accésAccés obert
Llevat que s'hi indiqui el contrari, els
continguts d'aquesta obra estan subjectes a la llicència de Creative Commons
:
Reconeixement-NoComercial-CompartirIgual 3.0 Espanya
Abstract
Recent works discuss the importance of the multiplicative closure of the Markov models used in phylogenetics. A sufficient condition is requiring the set of rate-matrices of the model to form a Lie algebra. In this work, we want to implement this algorithm to generate all models for a given symmetry. This implementation would be important for getting examples and investigate more properties of these models. Treballs recents discuteixen la importància de la clausura multiplicativa dels models de Markov que es fan servir en filogenètica. Una condició suficient és demanar que les matrius de taxes del model formin un àlgebra de Lie. A partir d'aquí, es discuteix la definició dels models de Lie Markov.Volem implementar un algoritme per generar tots els models per una simetria fixada donada per un grup de permutacions dels nucleòtids A,C,G,T. Aquesta implementació seria d'importància crucial per poder comptar amb exemples i poder investigar més propietats d'aquests models.
TitulacióMÀSTER UNIVERSITARI EN MATEMÀTICA AVANÇADA I ENGINYERIA MATEMÀTICA (Pla 2010)
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
memoria.pdf | 740,0Kb | Visualitza/Obre |