Search of phenotype-related candidate genes using Gene Ontology-based semantic similarity and protein interaction information: application to Brugada syndrome
Carregant...
Fitxers
El pots comprar en digital a:
El pots comprar en paper a:
Títol de la revista
ISSN de la revista
Títol del volum
Col·laborador
Editor
Tribunal avaluador
Realitzat a/amb
Tipus de document
Text en actes de congrés
Data publicació
Editor
IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers
Condicions d'accés
Accés obert
item.page.rightslicense
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització de la persona titular dels drets
Publicacions relacionades
Datasets relacionats
Projecte CCD
Abstract
This work presents a methodology for finding phenotype candidate genes starting from a set of known related genes. This is accomplished by automatically mining and organizing the available scientific literature using Gene Ontology-based semantic similarity. As a case study, Brugada syndrome related genes have been used as input in order to obtain a list of other possible candidate genes related with this disease. Brugada anomaly produces a typical alteration in the Electrocardiogram and carriers of the disease show an increased probability of sudden death. Results show a set of semantically coherent proteins that are shown to be related with synaptic transmission and muscle contraction physiological processes.
Descripció
Persones/entitats
Document relacionat
Versió de
Citació
Massanet, R. [et al.]. Search of phenotype-related candidate genes using Gene Ontology-based semantic similarity and protein interaction information: application to Brugada syndrome. A: IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference. "31st Annual International IEEE EMBS Conference". Minneapolis: IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, p. 7079-7082.