Cristal·lització de DNA ric en AT's en presència de fàrmacs
Visualitza/Obre
Memòria (16,16Mb) (Accés restringit)
Sol·licita una còpia a l'autor
Què és aquest botó?
Aquest botó permet demanar una còpia d'un document restringit a l'autor. Es mostra quan:
- Disposem del correu electrònic de l'autor
- El document té una mida inferior a 20 Mb
- Es tracta d'un document d'accés restringit per decisió de l'autor o d'un document d'accés restringit per política de l'editorial
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2099.1/10481
Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2010-09
Condicions d'accésAccés restringit per decisió de l'autor
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
En aquest treball s’han realitzat estudis estructurals d’oligonucleòtids rics en parells de
bases adenina i timina. En concret hem fet assaigs de cristal·litazió amb dos decàmers i dos
dodecàmers que son els següents:
• d(ATATATATAT)2 que abreugem com (AT)5
• d(AATATATATT)2 que abreugem com A(AT)4T
• d(CGATATATATCG)2 que abreugem com CG(AT)4CG
• d(AATATATATATT)2 que abreugem com A(AT)5T
Aquest oligonucleòtids rics en AT’s son representatius de grans zones del genoma comunes
a tots els organismes, conegudes com non coding DNA, les quals no codifiquen per cap
proteïna i es desconeix la funció biològica que puguin tenir.
L’objectiu ha estat formar complexes d’aquests troçets de DNA amb fàrmacs que
interaccionen en el solc menor del mateix, coneguts com minor groove binders, i resoldre la
seva estructura. Les drogues utilitzades han estat la pentamidina, el DAPi i el CD-27.
Això s’ha fet mitjançant la tècnica de difracció de raigs X de monocristall. Aquesta tècnica és
molt precisa i pot arribar a resolucions atòmiques ja que utilitza longituds d’ona comparables
a les distàncies interatòmiques , tot i que com a inconvenients té que és una tècnia molt
cara, lenta i laboriosa.
Com ha resultat dels assaigs cristal·logràfics s’han obtingut diversos cristalls bons, els quals
han estat difractats una part al sincrotró de Grenoble (ESRF) i l’altre a la Plataforma
Automatitzada de Cristal·lografia del Parc Científic de Barcelona.
De tots ells, els millors resultats han estat per un cristall format per (AT)5 i pentamidina. Ja
havíem fet estudis previs d’aquesta estructura, però aquesta vegada hem pogut resoldre-la a
alta resolució i veure aspectes importants que no quedaven clars.
La pentamidina es troba al solc menor central del dúplex, establint interaccions
electrostàtiques a través dels seus extrems carregats amb les fosfats d’oligonucleòtids
veïns, fent així una tasca d’entrecreuament cross-linking i estabilitzant l’estructura. Aquesta
interacció fàrmac-DNA no te antecedents bibliogràfics.
MatèriesCrystallization -- Industrial applications, Oligonucleotides, Drug interactions, DNA -- Structure, Medicaments -- Interacció, ADN -- Estructura, Cristal·lització -- Aplicacions industrials, Oligonucleòtids, Medicaments -- Interacció, ADN -- Estructura
TitulacióMÀSTER UNIVERSITARI EN POLÍMERS I BIOPOLÍMERS (Pla 2009)
Col·leccions
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
memoria TFM.pdf | Memòria | 16,16Mb | Accés restringit |