Use of Gene Ontology semantic information in protein interaction data visualization
Visualitza/Obre
Cita com:
hdl:2117/9708
Tipus de documentText en actes de congrés
Data publicació2008
EditorIEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
The Gene Ontology project is an effort to structure knowledge on biological products and processes by adding semantic information to them. This is done in a systematic way so that this additional information can be automatically processed. In this contribution a protein-protein interaction
visualization algorithm is proposed, which combines protein interaction data with Gene Ontology semantic information. The
information is integrated using a semantic distance measure defined in ontologies or taxonomies. Multidimensional scaling is applied to this measure and the output complements protein interaction data in building an interaction visualization map.
CitacióMassanet, R.; Caminal, P.; Perera, A. Use of Gene Ontology semantic information in protein interaction data visualization. A: IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering. "8th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering". Atenes: IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, p. 1-5.
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
04696741.pdf | 1,028Mb | Visualitza/Obre |