On the ancestral compatibility of two phylogenetic trees with nested taxa
Visualitza/Obre
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/84839
Tipus de documentReport de recerca
Data publicació2005-05
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
Compatibility of phylogenetic trees is the most important concept underlying widely-used methods for assessing the agreement of different phylogenetic trees with overlapping taxa and combining them into common supertrees to reveal the tree of life. The notion of ancestral compatibility of phylogenetic trees with nested taxa was introduced by P. Daniel and C. Semple in 2004. In this paper we analyze in detail the meaning of this compatibility from the points of view of the local structure of the trees, of the existence of embeddings into a common supertree, and of the joint properties of their cluster representations. Our analysis leads to a very simple polynomial-time algorithm for testing this compatibility, which we have implemented and is freely available for download from the BioPerl collection of Perl modules for computational biology.
CitacióLlabrés, M., Rocha, J., Rosselló, F., Valiente, G. "On the ancestral compatibility of two phylogenetic trees with nested taxa". 2005.
Forma partLSI-05-25-R
Col·leccions
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
R05-25.pdf | 207,9Kb | Visualitza/Obre |