Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO
Visualitza/Obre
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/16286
Tipus de documentArticle
Data publicació2011-12-01
Condicions d'accésAccés obert
Llevat que s'hi indiqui el contrari, els
continguts d'aquesta obra estan subjectes a la llicència de Creative Commons
:
Reconeixement-NoComercial-SenseObraDerivada 3.0 Espanya
Abstract
One of the main computational challenges facing metagenomic analysis is the taxonomic identification of short DNA fragments. The combination of sequence alignment methods with taxonomic assignment based on consensus can provide an accurate estimate of the microbial diversity in a sample. In this note, we show how recent improvements to these consensus methods, as implemented in the latest release of the TANGO tool, can provide an improved estimate of diversity in simulated datasets.
CitacióAlonso-Alemany, D. [et al.]. Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO. "EMBnet.journal", 01 Desembre 2011, vol. 17, núm. 2, p. 46-50.
ISSN1023-4144
Versió de l'editorhttp://journal.embnet.org/index.php/embnetjournal/article/view/237/531
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
D6A8Ed01.pdf | 426,4Kb | Visualitza/Obre |