Análisis de datos ómicos integrados : Aplicación usando paquete mixOmics
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Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
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Tipus de documentProjecte Final de Màster Oficial
Data2014-10
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Abstract
El paquete mixOmics nos permite analizar la integración de dos conjuntos de datos ómicos con salidas gráficas interpretables. Algunos métodos estadísticos implementados en este paquete que utilizamos en esta memoria son: sPCA, rCCA, (s)PLS modo canónico y regresión y (s)PLS-DA. La técnica disperso nos ayuda a mejorar el análisis de los datos de alta dimensionalidad, pues en la selección de variable utilizan la técnica Lasso y esto nos proporciona más eficiencia en los métodos estadísticos y sus salidas gráficas. En esta memoria usaremos dos conjuntos de datos reales ómicos, expresión genética(mRNA) y microRNAs, donde aplicaremos las técnicas estadísticas multivariantes avanzadas, ya mencionadas anteriormente, utilizando el paquete mixOmics. Analizaremos sus virtudes y desventajas de este paquete, los métodos estadísticos y además responder a la pregunta del investigador qué genes y microRNAs están asociados a los pacientes con síndrome de down.
TitulacióMÀSTER UNIVERSITARI EN ESTADÍSTICA I INVESTIGACIÓ OPERATIVA (Pla 2009)
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
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