DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/9948

Arxiu Descripció MidaFormat
05332912.pdf651,72 kBAdobe PDFThumbnail
Veure/Obrir

Citació: Maynou, J. [et al.]. Transcription factor binding site detection through position cross-mutual information variability analysis. A: Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. "31st Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS)". IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, p. 7087-7090.
Títol: Transcription factor binding site detection through position cross-mutual information variability analysis
Autor: Maynou Fernández, Joan Veure Producció científica UPC; Vallverdú Ferrer, Montserrat Veure Producció científica UPC; Clarià Sancho, Francesc; Gallardo Chacón, Joan Josep Veure Producció científica UPC; Caminal Magrans, Pere Veure Producció científica UPC; Perera Lluna, Alexandre Veure Producció científica UPC
Editorial: IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers
Data: 2009
Tipus de document: Conference lecture
Resum: Regulatory sequence detection is a fundamental challenge in computational biology. One key process in protein synthesis starts with the binding of the transcription factor to its binding site. Different sites can show binding to the same factor. This variability found in binding sequences increases the difficulty of their detection using computational algorithms. In this manuscript, a method for the detection of binding sites is proposed, based on the correlation between binding sequence positions through information theoretical measures. Efficiency values of the method are reported in the form of Receiver Operating Characteristic curves on the detection of different transcription factors of the Saccharomyces cerevisiae organism. We compare our results with other known motif detection Motif Discovery scan (MDscan).
URI: http://hdl.handle.net/2117/9948
DOI: 10.1109/IEMBS.2009.5332912
Apareix a les col·leccions:Altres. Enviament des de DRAC
SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics. Ponències/Comunicacions de congressos
Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial. Ponències/Comunicacions de congressos
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets.

Per a qualsevol ús que se'n vulgui fer no previst a la llei, dirigiu-vos a: sepi.bupc@upc.edu

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius