DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/9707

Arxiu Descripció MidaFormat
04696749.pdf2,71 MBAdobe PDFThumbnail
Veure/Obrir

Citació: Maynou, J. [et al.]. Detection of transcription factor binding sites using Rényi entropy. A: IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering. "8th. IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering". Atenes: IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, p. 1-5.
Títol: Detection of transcription factor binding sites using Rényi entropy
Autor: Maynou Fernández, Joan Veure Producció científica UPC; Vallverdú Ferrer, Montserrat Veure Producció científica UPC; Clarià, Francesc; Perera Lluna, Alexandre Veure Producció científica UPC; Caminal Magrans, Pere Veure Producció científica UPC
Editorial: IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers
Data: 2008
Tipus de document: Conference report
Resum: During the process of protein synthesis, transcription of DNA to messenger RNA starts with the binding of the transcription factors to the promoter. One of the issues on the prediction of transcription factor binding is that sequences corresponding to the binding present variability. In this manuscript a method for the detection of binding site is proposed, based on a parametric uncertainty measurement(Renyi entropy). This measurement is done through an estimation of the probability for each nucleotide avoiding any numerical representation of the nucleotides. We obtain values of the efficiency of the method as Receiver Operating Characteristic curves found on ABFl and ROXI binding sites in chromosome I and XVI of the organism Saccharomyces cerevisiae.
URI: http://hdl.handle.net/2117/9707
DOI: 10.1109/BIBE.2008.4696749
Versió de l'editor: http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=4696749
Apareix a les col·leccions:Altres. Enviament des de DRAC
SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics. Ponències/Comunicacions de congressos
Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial. Ponències/Comunicacions de congressos
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets.

Per a qualsevol ús que se'n vulgui fer no previst a la llei, dirigiu-vos a: sepi.bupc@upc.edu

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius