DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/8754

Arxiu Descripció MidaFormat
Bertran_JCC_31_2010_2669.doc914 kBMicrosoft WordVeure/Obrir

Títol: Incorporation of deMon2k as a new parallel quantum mechanical code for the PUPIL system
Autor: Bertran Cànovas, Òscar Veure Producció científica UPC; Trickey, Samuel; Torras Costa, Juan Veure Producció científica UPC
Data: 15-nov-2010
Tipus de document: Article
Resum: The PUPIL system is a combination of software and protocols for the systematic linkage and interoperation of molecular dynamics and quantum mechanics codes to perform QM/MD (sometimes called QM/MM) calculations. The Gaussian-03 and Amber packages were added to the Pupil suite recently. However, efficient parallel QM codes are critical because calculation of the QM forces is the overwhelming majority of the computational load. Here we report details of incorporation of the deMon2k density functional suite as a new parallel QM code. An additional motivation is to add a highly optimized, purely DFT code. We illustrate with a demonstration study of the influence of perchlorate as a dopant ion of the poly(3,4-ethylenedioxythiophene) conducting polymer in explicit acetonitrile solvent using Amber and deMon2k. We discuss unanticipated requirements for use of a scheme for semi-empirical correction of Kohn-Sham eigenvalues to give physically meaningful one-electron gap energies. We provide comparison of both geometric parameters and electronic properties for non-doped and doped systems. We also present results comparing deMon2k and Gaussian03 calculation of forces for a short sequence of steps. And we discuss briefly some difficult problems of quantum zone scf convergence for the anionically doped system. The difficulties seem to be caused by well-know deficiencies in simple approximate exchange-correlation functionals.
ISSN: 0192-8651
URI: http://hdl.handle.net/2117/8754
DOI: 10.1002/jcc.21553
Versió de l'editor: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jcc.21553/abstract
Apareix a les col·leccions:IMEM - Innovació, Modelització i Enginyeria en (BIO) Materials. Articles de revista
Departament d'Enginyeria Química. Articles de revista
Departament de Física Aplicada. Articles de revista
Altres. Enviament des de DRAC
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets.

Per a qualsevol ús que se'n vulgui fer no previst a la llei, dirigiu-vos a: sepi.bupc@upc.edu

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius