Computational investigation of the conformational profile of the four stereomers of Ac-L-Pro-c(3)Phe-NHMe (c(3)Phe= 2,3-methanophenylalanine)
Visualitza/Obre
computational.pdf (443,9Kb) (Accés restringit)
Sol·licita una còpia a l'autor
Què és aquest botó?
Aquest botó permet demanar una còpia d'un document restringit a l'autor. Es mostra quan:
- Disposem del correu electrònic de l'autor
- El document té una mida inferior a 20 Mb
- Es tracta d'un document d'accés restringit per decisió de l'autor o d'un document d'accés restringit per política de l'editorial
Estadístiques de LA Referencia / Recolecta
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/7536
Tipus de documentArticle
Data publicació2009
Condicions d'accésAccés restringit per política de l'editorial
Llevat que s'hi indiqui el contrari, els
continguts d'aquesta obra estan subjectes a la llicència de Creative Commons
:
Reconeixement-NoComercial-SenseObraDerivada 3.0 Espanya
Abstract
The present report regards a computational study aimed at assessing the conformational profile of the four stereoisomers of the peptide Ace-Pro-c3Phe-NMe, previously reported to exhibit b-turn structures in dichloromethane with different type I/type II b-turn profiles. Molecular systems were represented at the molecular mechanics level using the parm96 parameterization of the AMBER force field. Calculations were carried out in dichloromethane using an implicit solvent approach. Characterization of the conformational features of the peptide analogs was carried out using simulated annealing (SA), molecular dynamics (MD) and replica exchange molecular dynamics (REMD). Present results show that MD calculations do not provide a reasonable sampling after 300 ns. In contrast, both SA and REMD provide similar results and agree well with experimental observations.
CitacióRodríguez, A. [et al.]. Computational investigation of the conformational profile of the four stereomers of Ac-L-Pro-c(3)Phe-NHMe (c(3)Phe= 2,3-methanophenylalanine). "Biopolymers", 2009, vol. 92, núm. 6, p. 518-524.
ISSN0006-3525
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
computational.pdf | 443,9Kb | Accés restringit |