DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/6910

Ítem no disponible en accés obert per política de l'editorial

Arxiu Descripció MidaFormat
Parametrization of the torsional potential.pdf811,29 kBAdobe PDF Accés restringit

Citació: Preat, J. [et al.]. Parameterization of the torsional potential for calix[4]arene-substituted poly(thiophene)s. "Journal of computational chemistry", Juny 2010, vol. 31, núm. 8, p. 1741-1751.
Títol: Parameterization of the torsional potential for calix[4]arene-substituted poly(thiophene)s
Autor: Preat, Julien; Rodríguez Ropero, Francisco Veure Producció científica UPC; Torras Costa, Juan Veure Producció científica UPC; Bertran Cànovas, Òscar Veure Producció científica UPC; Zanuy Gomara, David Veure Producció científica UPC; Alemán Llansó, Carlos Veure Producció científica UPC
Data: jun-2010
Tipus de document: Article
Resum: Three different strategies have been followed to develop the torsional force-field parameters of the interring dihedral angles for calix[4]arene-substituted poly(thiophene)s, a family of highly sensitive ion receptors. These procedures, which are based on the rotational profiles calculated using quantum mechanical methods, differ in the complexity of the model compounds and the processing applied to the quantum mechanical energies before the fitting. The performance of the three sets of developed parameters, which are essentially compatible with the General Amber Force Field, has been evaluated by computing the potential of mean forces for the inter-ring rotation of 2,2'-bithiophene, and its substituted analog bearing a calix[4]arene group in different environments. Finally, the ability of the new sets of torsional parameters to describe a calix[4]arene-substituted poly(thiophene) in tetrahydrofuran solution has been checked using Molecular Dynamics simulations. Specifically, the molecular shape, the polymer conformation, and the effects of the Na+ ions trapped in the cavity of the receptor have been examined. Although the potential derived from unsubstituted 2,2'-bithiophene is able to reproduce the experimental free energies of the minima, the overall results indicate that the parameters derived from the analog bearing a calix[4]arene group provide the best description of the systems under study. This should be attributed to the strong constraints found in complex substituted poly(thiophene)s, which require parameterization strategies able to capture all the interactions and phenomena involved in their inter-ring rotations.
ISSN: 0192-8651
URI: http://hdl.handle.net/2117/6910
DOI: 10.1002/jcc.21463
Versió de l'editor: http://www3.interscience.wiley.com/journal/123216478/abstract
Apareix a les col·leccions:IMEM - Innovació, Modelització i Enginyeria en (BIO) Materials. Articles de revista
Departament d'Enginyeria Química. Articles de revista
Altres. Enviament des de DRAC
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets.

Per a qualsevol ús que se'n vulgui fer no previst a la llei, dirigiu-vos a: sepi.bupc@upc.edu

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius