Parsimonious selection of useful genes in microarray gene expression data
Visualitza/Obre
10.1007/978-1-4419-7046-6_5
Inclou dades d'ús des de 2022
Cita com:
hdl:2117/19482
Tipus de documentCapítol de llibre
Data publicació2011
EditorSpringer
Condicions d'accésAccés obert
Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i
industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva
reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets
Abstract
Machine Learning methods have of late made significant efforts to solving multidisciplinary problems in the field of cancer classification in microarray gene expression data. These tasks are characterized by a large number of features and a few observations, making the modeling a non-trivial undertaking. In this work we apply entropic filter methods for gene selection, in combination with several off-the-shelf classifiers. The introduction of bootstrap resampling techniques permits the achievement of more stable performance estimates. Our findings show that the proposed methodology permits a drastic reduction in dimension, offering attractive solutions both in terms of prediction accuracy and number of explanatory genes; a dimensionality reduction technique preserving discrimination capabilities is used for visualization of the selected genes.
CitacióGonzález, F.F.; Belanche, Ll. Parsimonious selection of useful genes in microarray gene expression data. A: "Software tools and algorithms for biological systems". Springer, 2011, p. 45-55.
ISBN978-1-4419-7046-6
Versió de l'editorhttps://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4419-7046-6
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
---|---|---|---|---|
spg1380.pdf | 154,1Kb | Visualitza/Obre |