DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/16286

Arxiu Descripció MidaFormat
D6A8Ed01.pdf426,45 kBAdobe PDFThumbnail
Veure/Obrir

Citació: Alonso-Alemany, D. [et al.]. Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO. "EMBnet.journal", 01 Desembre 2011, vol. 17, núm. 2, p. 46-50.
Títol: Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO
Autor: Alonso-Alemany, Daniel Veure Producció científica UPC; Clemente, José C.; Jansson, Jesper; Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro Veure Producció científica UPC
Data: 1-des-2011
Tipus de document: Article
Resum: One of the main computational challenges facing metagenomic analysis is the taxonomic identification of short DNA fragments. The combination of sequence alignment methods with taxonomic assignment based on consensus can provide an accurate estimate of the microbial diversity in a sample. In this note, we show how recent improvements to these consensus methods, as implemented in the latest release of the TANGO tool, can provide an improved estimate of diversity in simulated datasets.
ISSN: 1023-4144
URI: http://hdl.handle.net/2117/16286
Versió de l'editor: http://journal.embnet.org/index.php/embnetjournal/article/view/237/531
Apareix a les col·leccions:Altres. Enviament des de DRAC
ALBCOM - Algorismia, Bioinformàtica, Complexitat i Mètodes Formals. Articles de revista
Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics. Articles de revista
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Aquest ítem (excepte textos i imatges no creats per l'autor) està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons
Creative Commons

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius