|
E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >
Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/2117/16286
|
| Citació: | Alonso-Alemany, D. [et al.]. Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO. "EMBnet.journal", 01 Desembre 2011, vol. 17, núm. 2, p. 46-50. |
| Títol: | Taxonomic assignment in metagenomics with TANGO |
| Autor: | Alonso-Alemany, Daniel  ; Clemente, José C.; Jansson, Jesper; Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro |
| Data: | 1-des-2011 |
| Tipus de document: | Article |
| Resum: | One of the main computational challenges facing metagenomic analysis is the taxonomic identification of short DNA fragments. The combination of sequence alignment methods with taxonomic assignment based on consensus can provide an accurate estimate of the microbial diversity in a sample. In this note, we show how recent improvements to these consensus methods, as implemented in the latest release of the TANGO tool, can provide an improved estimate of diversity in simulated datasets. |
| ISSN: | 1023-4144 |
| URI: | http://hdl.handle.net/2117/16286 |
| Versió de l'editor: | http://journal.embnet.org/index.php/embnetjournal/article/view/237/531 |
| Apareix a les col·leccions: | Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics. Articles de revista
ALBCOM - Algorismia, Bioinformàtica, Complexitat i Mètodes Formals. Articles de revista
Altres. Enviament des de DRAC
|
| Comparteix: |
|
Aquest ítem (excepte textos i imatges no creats per l'autor) està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons
|
Català
Castellano
English
