Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas
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Tipus de documentComunicació de congrés
Data publicació2010
EditorUNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID
Condicions d'accésAccés obert
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Abstract
En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de explotar, estructurar y organizar esta información para poder sacar partido de ella. Sin embargo, a día de hoy no existe ninguna aplicación que caracterice el entorno en el que una
proteína o conjunto de proteínas actúa. En este trabajo se ha desarrollado un paquete de software que consulta, de forma masiva, bases de datos publicas, como Gene Ontology Annotation (GOA) y Human Proteome Resource Database (HPRD) y presenta la información en ellas contenida
de forma que pueda ser fácil y rápidamente interpretada por personas pertenecientes al entorno clínico y no familiarizadas con el uso de bases de datos. Para ello presenta al usuario un conjunto de grupos de proteínas que forman parte del entorno de interacción local del conjunto inicial de proteínas y que forman subredes de alta conectividad. Además describe con etiquetas semánticas los aspectos particulares de cada grupo.
CitacióMassanet-Vila, R. [et al.]. Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas. A: Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica. "Libro de Actas del XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010)". Madrid: UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID, 2010, p. 1-6.
Dipòsit legalM-49430-2010
ISBN978-84-8058-1
Versió de l'editorhttp://cataleg.upc.edu/record=b1304479~S1*cat
Fitxers | Descripció | Mida | Format | Visualitza |
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Massanet caseib_2010_2.pdf | 119,4Kb | Visualitza/Obre |