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Citació: Massanet-Vila, R. [et al.]. Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas. A: Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica. "Libro de Actas del XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010)". Madrid: UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID, 2010, p. 1-6.
Títol: Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas
Autor: Massanet Vila, Raimon Veure Producció científica UPC; Gallardo Chacón, Joan Josep Veure Producció científica UPC; Caminal Magrans, Pere Veure Producció científica UPC; Perera Lluna, Alexandre Veure Producció científica UPC
Editorial: UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID
Data: 2010
Tipus de document: Conference lecture
Resum: En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de explotar, estructurar y organizar esta información para poder sacar partido de ella. Sin embargo, a día de hoy no existe ninguna aplicación que caracterice el entorno en el que una proteína o conjunto de proteínas actúa. En este trabajo se ha desarrollado un paquete de software que consulta, de forma masiva, bases de datos publicas, como Gene Ontology Annotation (GOA) y Human Proteome Resource Database (HPRD) y presenta la información en ellas contenida de forma que pueda ser fácil y rápidamente interpretada por personas pertenecientes al entorno clínico y no familiarizadas con el uso de bases de datos. Para ello presenta al usuario un conjunto de grupos de proteínas que forman parte del entorno de interacción local del conjunto inicial de proteínas y que forman subredes de alta conectividad. Además describe con etiquetas semánticas los aspectos particulares de cada grupo.
ISBN: 978-84-8058-1
Dipòsit legal: M-49430-2010
URI: http://hdl.handle.net/2117/14481
Versió de l'editor: http://cataleg.upc.edu/record=b1304479~S1*cat
Apareix a les col·leccions:Altres. Enviament des de DRAC
SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics. Ponències/Comunicacions de congressos
Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial. Ponències/Comunicacions de congressos
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