DSpace DSpace UPC
 Català   Castellano   English  

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/13711

Ítem no disponible en accés obert per política de l'editorial

Arxiu Descripció MidaFormat
Large neighbourhood search algorithms....pdf344,81 kBAdobe PDF Accés restringit

Citació: Roli, A. [et al.]. Large neighbourhood search algorithms for the founder sequence reconstruction problem. "Computers & operations research", Febrer 2012, vol. 39, núm. 2, p. 213-224.
Títol: Large neighbourhood search algorithms for the founder sequence reconstruction problem
Autor: Roli, Andrea; Benedettini, Stefano; Stützle, Thomas; Blum, Christian Veure Producció científica UPC
Data: feb-2012
Tipus de document: Article
Resum: The reconstruction of founder genetic sequences of a population is a relevant issue in evolutionary biology research. The problem consists in finding a biologically plausible set of genetic sequences (founders), which can be recombined to obtain the genetic sequences of the individuals of a given population. The reconstruction of these sequences can be modelled as a combinatorial optimisation problem in which one has to find a set of genetic sequences such that the individuals of the population under study can be obtained by recombining founder sequences minimising the number of recombinations. This problem is called the founder sequence reconstruction problem. Solving this problem can contribute to research in understanding the origins of specific genotypic traits. In this paper, we present large neighbourhood search algorithms to tackle this problem. The proposed algorithms combine a stochastic local search with a branch-and-bound algorithm devoted to neighbourhood exploration. The developed algorithms are thoroughly evaluated on three different benchmark sets and they establish the new state of the art for realistic problem instances.
ISSN: 0305-0548
URI: http://hdl.handle.net/2117/13711
DOI: 10.1016/j.cor.2011.03.012
Versió de l'editor: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0305054811000852
Apareix a les col·leccions:Altres. Enviament des de DRAC
ALBCOM - Algorismia, Bioinformàtica, Complexitat i Mètodes Formals. Articles de revista
Departament de Ciències de la Computació. Articles de revista
Comparteix:


Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

SFX Query

Tots els drets reservats. Aquesta obra està protegida pels drets de propietat intel·lectual i industrial corresponents. Sense perjudici de les exempcions legals existents, queda prohibida la seva reproducció, distribució, comunicació pública o transformació sense l'autorització del titular dels drets.

Per a qualsevol ús que se'n vulgui fer no previst a la llei, dirigiu-vos a: sepi.bupc@upc.edu

 

Valid XHTML 1.0! Programari DSpace Copyright © 2002-2004 MIT and Hewlett-Packard Comentaris
Universitat Politècnica de Catalunya. Servei de Biblioteques, Publicacions i Arxius