Visualization of sequence and structural features of genomes and chromosome fragments. Application to CpG islands, Alu sequences and whole genomes

doi:10.1016/j.gene.2010.11.008


Català Castellano English

	Pàgina d'inici
	Estadístiques d'ús

Llistar
	Comunitats
	Títol
	Autor
	Data
	Matèria
	Àrees temàtiques de la UPC

Serveis
	Alertes
	El meu E-prints UPC usuaris autoritzats
	Editar perfil
	Entrada usuaris no UPC



	Sobre DSpace

	Bibliotècnica: la biblioteca digital de la UPC

E-prints UPC >
Altres >
Enviament des de DRAC >

Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem: http://hdl.handle.net/2117/13244

Ítem no disponible en accés obert per política de l'editorial

Arxiu	Descripció	Mida	Format
Visualization of sequence and structructural features of genomes and chromosome fragments....pdf	"Review"	2.04 MB	Adobe PDF

Citació:	Subirana, J.; Anokian, E. Visualization of sequence and structural features of genomes and chromosome fragments. Application to CpG islands, Alu sequences and whole genomes. "Gene", 01 Març 2011, vol. 473, núm. 2, p. 76-81.
Títol:	Visualization of sequence and structural features of genomes and chromosome fragments. Application to CpG islands, Alu sequences and whole genomes
Autor:	Subirana Torrent, Juan A. ; Anokian, Ezequiel
Data:	1-mar-2011
Tipus de document:	Article
Resum:	A very simple new program is presented (G-SQUARES). It is useful in order to visualize the composition and basic structural features of whole genomes and selected chromosome regions. The frequency of all dimer and tetramer sequences is reported. Overall structural features are calculated, such as the tendency for alternation. A direct visual comparison among different sequences is easily available. Furthermore, the features which are visualized indicate further studies which should be carried out. Examples are presented on Alu sequences, CpG islands, whole eukaryotic and bacterial genomes.
ISSN:	0378-1119
URI:	http://hdl.handle.net/2117/13244
Versió de l'editor:	10.1016/j.gene.2010.11.008
Apareix a les col·leccions:	Altres. Enviament des de DRAC Departament d'Enginyeria Química. Articles de revista MACROM - Cristal·lografia, Estructura i Funció de Macromolècules Biològiques. Articles de revista
Comparteix:

Stats Mostra les estadístiques d'aquest ítem

Queda prohibida la reproducció, transformació, distribució i comunicació pública d'aquesta obra. Es permet, en tot cas, la reproducció per a ús privat sempre i quan la còpia que se'n faci no sigui objecte d'utilització col·lectiva ni lucrativa (art. 31.2 del Reial Decret Legislatiu 1/1996, de 12 d'abril, pel qual s'aprova el Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual, http://bibliotecnica.upc.es/sepi/legislacio.asp).

Per a qualsevol ús que es vulgui fer diferent al permès, dirigiu-vos a: sepi@upc.edu