Ara es mostren els items 1-20 de 25

  • A Compositional Approach to Allele Sharing Analysis 

    Galván Femenía, Iván; Graffelman, Jan (Springer, 2016)
    Capítol de llibre
    Accés restringit per política de l'editorial
    Relatedness is of great interest in population-based genetic association studies. These studies search for genetic factors related to disease. Many statistical methods used in population-based genetic association studies ...
  • A genetic association study of colon cancer 

    Densalat Ventayol, Júlia (Universitat Politècnica de Catalunya, 2014-07)
    Treball Final de Grau
    Accés obert
    The project of this bachelor degree concerns the statistical analysis of a genetic database provided by Professor Victor Moreno, epidemiologist of the Hospital de Bellvitge in Barcelona. The goal is to investigate associations ...
  • A genome-wide study of Hardy–Weinberg equilibrium with next generation sequence data 

    Graffelman, Jan; Jain, Deepti; Weir, B.S. (2017-04-03)
    Article
    Accés obert
    Statistical tests for Hardy–Weinberg equilibrium have been an important tool for detecting genotyping errors in the past, and remain important in the quality control of next generation sequence data. In this paper, we ...
  • A Mathematical model of the spread of two viral sub-types on a Plant Leaf (Numerical Simulation) 

    Ramchand Lalwani, Nitin (Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-06)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés restringit per decisió de l'autor
    Whilst in humans free virus particles and host cells are assumed to be homogenously mixed, in plants, the spatial component is a key factor. The natural proliferation of the virus through a plant is known to happen from a ...
  • Algorismes genètics aplicats a ciències de la vida 

    Grau Cuscó, Raimon (Universitat Politècnica de Catalunya, 2010-01-27)
    Projecte/Treball Final de Carrera
    Accés obert
  • Análisis molecular de mutaciones en proteinas de células fotorreceptoras asociadas a retinosis pigmentaria 

    Urtubia Vicario, César; Ramon Portés, Eva; Valle Mendoza, Luis Javier del; Götzens García, Guadalupe; Garriga Solé, Pere (ICM, 2002-12)
    Article
    Accés obert
  • Applications of the Sinkhorn-Knopp algorithm for phylogenetic inference 

    Mateo Campo, Clara (Universitat Politècnica de Catalunya, 2016-01)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés obert
    En aquest treball s'estudia l'algorisme de Sinkhorn-Knopp i les seves aplicacions pel disseny de mètodes de reconstrucció filogenètica. Es dissenyen tres mètodes filogenètics ("Crossing", "$\delta$-crossing$ i Dist-crossing) ...
  • Characterization of phylogenetic networks with NetTest 

    Arenas, Miguel; Patricio, Mateus; Posada, David; Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro (2010-05-20)
    Article
    Accés obert
    Background: Typical evolutionary events like recombination, hybridization or gene transfer make necessary the use of phylogenetic networks to properly depict the evolution of DNA and protein sequences. Although several ...
  • Comparison of Tree-Child Phylogenetic Networks 

    Cardona, Gabriel; Rosselló, Francesc; Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro (2009-11-03)
    Article
    Accés obert
    Phylogenetic networks are a generalization of phylogenetic trees that allow for the representation of nontreelike evolutionary events, like recombination, hybridization, or lateral gene transfer. While much progress has ...
  • Estrategias de análisis de interacciones gen-ambiente en estudios GWAS 

    Alonso Aguado, Maria Henar (Universitat Politècnica de Catalunya, 2014-06)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés restringit per decisió de l'autor
    Se realizaron estudios de asociación para encontrar los SNP de susceptibilidad para el riesgo de cáncer colorrectal y la interacción con el Índice de Masa Corporal (IMC). Este estudio de epidemiología genética está compuesto ...
  • Estudio de la dinámica de un ecosistema marino 

    Castellví Linde, Gloria (Universitat Politècnica de Catalunya, 2016-05)
    Treball Final de Grau
    Accés obert
    Realitzat a/amb:  Institut de Ciències del Mar
    La aportación de los Sistemas dinámicos al estudio de modelos en Biología ha sido importante ya desde los primeros ejemplos asociados a dinámica de poblaciones: modelos depredador-presa, competición entre especies y muchos ...
  • Functional protein-based nanomaterial produced in microorganisms recognized as safe: A new platform for biotechnology 

    Cano Garrido, Olivia; Sanchez Chardi, Alejandro; Parés, Silvia; Giró, Irene; Tatkiewicz, Witold I.; Ferrer Miralles, Neus; Ratera, Imma; Natalello, Antonino; Cubarsí Morera, Rafael; Veciana Miró, Jaume; Bach, Alex; Villaverde Corrales, Antonio Pedro; Arís, Anna; García Fruitós, Elena (2016-10-01)
    Article
    Accés restringit per política de l'editorial
    Inclusion bodies (IBs) are protein-based nanoparticles formed in Escherichia coli through stereospecific aggregation processes during the overexpression of recombinant proteins. In the last years, it has been shown that ...
  • Looking for transcription factor binding sites 

    Roca Lacostena, Jordi (Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-10)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés restringit per acord de confidencialitat
    Transcription factors are proteins involved in the regulation of DNA transcription. Indeed they are the proteins which enable or disable the RNA-polymerase production. In order to do so, transcription factors are bound at ...
  • Mapping the genetic component of gene expression variance with Mixed Graphical Markov Models : the marginal case 

    Coca Mariné, Ignacio (Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-10)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés obert
    Realitzat a/amb:  Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
    En este trabajo desarrollamos la teoría de los modelos gráficos mixtos de Markov (GMMs), y en concreto los modelos heterogéneos. Aplicamos esta teoría a la búsqueda de marcadores génicos que afectan a la varianza de la ...
  • Mathematical topics in phylogenetics 

    Pérez De Los Cobos Hermosa, Cassius Manuel (Universitat Politècnica de Catalunya / Universität Wien, 2017-03)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés obert
    Realitzat a/amb:  Universität Wien - Max F. Perutz Laboratories
    An evolutionary process is frequently modeled as a sequence of the four bases A,C,G,T, each of them changing independently following a Markov process. The main goal of this project are two: first of all, we wanted to ...
  • Maximum likelihood estimation of linkage disequilibrium 

    Masós Torró, Clàudia (Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-05)
    Treball Final de Grau
    Accés restringit per decisió de l'autor
    This project develops the theory of linkage disequilibrium (LD) estimation for a pair of genetic markers using the maximum likelihood function of a multinomial distribution. Basic statistics for LD such as $D$, $D'$ and ...
  • Métodos para la determinación de genotipos a partir de datos de microarrays de genotipado 

    Rodríguez Casado, Clara Isabel (Universitat Politècnica de Catalunya / Universitat de Barcelona, 2014-06)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés restringit per decisió de l'autor
    Este proyecto se enmarca en el análisis de datos de un estudio de epidemiología genética que tiene por objetivo final identificar genes asociados al desarrollo de cáncer. Se analizarán datos genéticos obtenidos en un estudio ...
  • Modelling "calçots" (Allium cepa L.) growth by Gompertz function 

    Simó, Joan; Plans, Marçal; Casañas, Francesc; Sabaté, Jose (Institut d'Estadística de Catalunya, 2013)
    Article
    Accés obert
    "Calçots" are the second-year resprouts of the "Ceba Blanca Tardana de Lleida" landrace of onions. The evolution of three "calçots" populations has been modeled to help farmers to plan the optimal time to harvest. Four ...
  • Modelling and analysis of crayfish competition 

    Solà Lorente, Jaume (Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-09)
    Treball Final de Grau
    Accés restringit per acord de confidencialitat
    Realitzat a/amb:  Technische Universität München. Fakultät für Mathematik
    The thesis will be divided in five chapters, the first one will give an introduction to all mathematical tools used throughout the thesis. This will be followed by the introduction of the discrete Buchanan model, with an ...
  • Modelling within-host viral evolution with cross-immunity. Numerical simulation of the model 

    Van Laarhoven, Narani (Universitat Politècnica de Catalunya, 2014-07)
    Projecte Final de Màster Oficial
    Accés restringit per acord de confidencialitat
    In the last twenty years, a considerable amount of research has been done in order to mathematically study the dynamics of viruses and immunity, and HIV in particular. The aim of this thesis is to further develop a ...