Exploració per altres contribucions "Casanellas Rius, Marta"
Ara es mostren els items 1-20 de 23
-
Algebraic and semi-algebraic phylogenetic reconstruction
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2021-07-22)
Tesi
Accés obertPhylogenetics is the study of the evolutionary history and relationships among groups of biological entities (called taxa). The modeling of those evolutionary processes is done by phylogenetic trees whose nodes represent ... -
Algebraic invariants of phylogenetic networks
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-05-02)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obertPhylogenetics is a scientific field that focuses on understanding the evolutionary relationships between living organisms. Specifically, it seeks to reconstruct the evolutionary history of these organisms and the ... -
Algebraic phylogenetic reconstruction based on proteins and its application to Persea americana
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2018-09)
Treball Final de Grau
Accés obertPhylogenetic reconstruction methods attempt to infer the evolutionary relationships among a group of species. Apart from classical reconstruction methods, new methods have been developed based on algebraic relationships ... -
Algebraic statistics in phylogenetic reconstruction: incorporating invariable sites
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-06)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obertIn modern phylogenetics, when comparing sequences of DNA the traditional approach assumes that nu- cleotide substitutions follow a Markov model, that sites on a DNA sequence evolve independently and in the same way. However, ... -
Algebraic tools in phylogenomics.
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2012-03-16)
Tesi
Accés obertEn aquesta tesi interdisciplinar desenvolupem eines algebraiques per a problemes en filogenètica i genòmica. Per estudiar l'evolució molecular de les espècies sovint s'usen models evolutius estocàstics. L'evolució es ... -
Application of algebraic techniques to phylogenetic reconstruction
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-05)
Treball Final de Grau
Accés obertPhylogenetics is the study of the evolutionary relationships among different species through the analysis of sequences of biological data such as DNA. These relationships are usually represented using phylogenetic trees, ... -
Centre d'Interpretació del Quaternari a Viladecans : Projectes IX, Línia Edificació, curs 2010/11
(ETSAB, 2011)
Llibre
Accés obert -
Expectation Maximitzation per a arbres filogenètics|
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2011-02)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obertAnàlisi exhaustiu del mètode EM aplicat a la reconstrucció filogenètica. Aplicació del mètode per a la reconstrucció de topologies sobre dades simulades sota un model K3. Aplicació i comparació amb altres mètodes de ... -
Expectation-maximization for evolutionary models
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-06-29)
Treball Final de Grau
Accés obertPhylogenetics plays a crucial role in enhancing our understanding of molecular sequence evolution and is regarded as one of the most effective tools for studying the origin of contagious diseases. This thesis explores the ... -
Hunting for keystones: Methodologies for the identification of relevant species from microbiome datasets and co-occurrence networks
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2022-10)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés restringit per acord de confidencialitat
Realitzat a/amb: Institut de Recerca Biomèdica -
Implementation of a test for branch saturation in a phylogenetic tree
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2022-10)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obert
Realitzat a/amb: Center for Integrative Bioinformatics ViennaIn a phylogenetic tree, branch saturation is the occurrence of too many mutations along a branch as to provide information about the branch location and length. Since branch saturation leads to unreliable reconstructed ... -
Learning substitution parameters on phylogenetic trees
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-06-29)
Treball Final de Grau
Accés obertThe evolution of molecular sequences can be modeled by a Markov process on a phylogenetic tree, a common representation of the evolutionary relationships among biological entities. Under theoretical conditions, that is, ... -
Learning substitution parameters on phylogenetic trees
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-06-29)
Treball Final de Grau
Accés obertL'evolució de seqüències moleculars es pot modelitzar utilitzant un procés de Markov en un arbre filogenètic, una de les representacions més habituals de les relacions evolutives entre diferents entitats biològiques. Sota ... -
Linear invariants for the equal-input evolutionary model
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2017-07)
Treball Final de Grau
Accés obertMathematical models for describing biological systems are becoming more and more important nowadays. In this thesis we will study Markov processes on phylogenetic trees and deeply study the equal-input model, which is the ... -
Mapping the genetic component of gene expression variance with Mixed Graphical Markov Models : the marginal case
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-10)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obert
Realitzat a/amb: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la SalutEn este trabajo desarrollamos la teoría de los modelos gráficos mixtos de Markov (GMMs), y en concreto los modelos heterogéneos. Aplicamos esta teoría a la búsqueda de marcadores génicos que afectan a la varianza de la ... -
Mathematical topics in phylogenetics
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2017-03)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obert
Realitzat a/amb: Max F. Perutz Laboratories / Universität WienAn evolutionary process is frequently modeled as a sequence of the four bases A,C,G,T, each of them changing independently following a Markov process. The main goal of this project are two: first of all, we wanted to ... -
Multilinear algebra for phylogenetic reconstruction
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2015-07)
Projecte Final de Màster Oficial
Accés obertPhylogenetic reconstruction tries to recover the ancestral relationships among a group of contemporary species and represent them in a phylogenetic tree. To do it, it is useful to model evolution adopting a parametric ... -
Performance of subflattening matrices for phylogenetic tree reconstruction
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2023-06)
Treball Final de Grau
Accés obertEn aquest projecte s'estudia a fons la definició de matrius "subflattening", i es proporcionen detalls addicionals que faltaven a la demostració del Teorema d'en Jeremy G. Sumner. Concretament, s'estudia en detall el cas ... -
Phylogenetic reconstruction based on algebra
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2019-01)
Treball Final de Grau
Accés obertIn this work we have aimed to discuss the theoretical foundations of quartet reconstruction with algebraic techniques and then implement some new quartet inference measures and test their performance on a subset of the ... -
Phylogenetics and rank of matrices
(Universitat Politècnica de Catalunya, 2014-07)
Treball Final de Grau
Accés obertPhylogenetics is the study of the evolutionary relationships of a group of species, and it is usually inferred from the DNA sequences of a set of living species. Thanks to the model developed by Darwin based on natural ...
