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  • An information theory-based tool for characterizing the interaction environment of a protein 

    Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (2010)
    Comunicació de congrés
    Accés obert
    In recent years large amounts of information have been accumulated in proteomic, genetic and metabolic databases. Much effort has been dedicated to developing methods that successfully exploit, organize and structure this ...
  • Analysis of incomplete gene expression dataset through protein-protein interaction information 

    Massanet Vila, Raimon; Padró Capmany, Teresa; Cardús, Anna; Badimón, Lina; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (2011)
    Text en actes de congrés
    Accés restringit per política de l'editorial
    This paper shows a graph based method to analyze proteomic expression data. The method allows the prediction of the expression of genes not measured by the gene expression technology based on the local connectivity properties ...
  • Caracterización y análisis de las interacciones de regulación entre los factores de transcripción y los genes 

    Maynou Fernández, Joan; Pairó Castiñeira, Erola; Massanet Vila, Raimon; Vallverdú Ferrer, Montserrat; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (2011)
    Text en actes de congrés
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    El estudio y la comprensión de las redes de interacción entre proteínas es fundamental para entender el funcionamiento de los diferentes procesos biológicos a nivel celular. El conjunto de interacciones entre proteínas, ...
  • Graph theory-based measures as predictors of gene morbidity 

    Massanet Vila, Raimon; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010)
    Article
    Accés obert
    Previous studies have suggested that some graph properties of protein interaction networks might be related with gene morbidity. In particular, it has been suggested that when a polymorphism affects a gene, it is more ...
  • Herramientas bioinformáticas para el análisis de resultados de experimentos de expresión génica 

    Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Padró Capmany, Teresa; Badimón, Lina; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID, 2010)
    Comunicació de congrés
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    En este estudio se propone una metodología que combina datos de expresión diferencial con información de expresión entre proteínas. El objetivo es enriquecer los resultados de un experimento de expresión con nuevos genes ...
  • Medidas basadas en teoría de grafos y la predicción de la morbosidad de genes 

    Massanet Vila, Raimon; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (2012)
    Comunicació de congrés
    Accés obert
    Estudios previos sugieren que las redes de interacción entre proteínas presentan propiedades de la teoría de grafos que pueden tener cierta relación con la morbosidad de los genes. En particular, se ha sugerido que cuando ...
  • Network-based enrichment analysis of gene expression through protein-protein interaction data 

    Massanet Vila, Raimon; Fernández Albert, Francesc; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (IEEE, 2012)
    Text en actes de congrés
    Accés restringit per política de l'editorial
    High-throughput analysis of gene expression data is subject to technological and statistical issues that confuse the underlying expression-condition associations. In this contribution a network-based candidate gene ...
  • Search of phenotype-related candidate genes using Gene Ontology-based semantic similarity and protein interaction information: application to Brugada syndrome 

    Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009)
    Text en actes de congrés
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    This work presents a methodology for finding phenotype candidate genes starting from a set of known related genes. This is accomplished by automatically mining and organizing the available scientific literature using ...
  • Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas 

    Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID, 2010)
    Comunicació de congrés
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    En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de ...
  • Use of Gene Ontology semantic information in protein interaction data visualization 

    Massanet Vila, Raimon; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre (IEEE Press. Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008)
    Text en actes de congrés
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    The Gene Ontology project is an effort to structure knowledge on biological products and processes by adding semantic information to them. This is done in a systematic way so that this additional information can be ...